Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP2Q86UW6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms