Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms