Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD4Q7Z3J3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD4Q7Z3J3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms