Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms