Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms