Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms