Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms