Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms