Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms