Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TBC1D3CQ6IPX1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TBC1D3CQ6IPX1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms