Protein–RNA interactions for Protein: Q64LD2

WDR25, WD repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR25Q64LD2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR25Q64LD2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms