Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRAMEF6Q5VXH4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRAMEF6Q5VXH4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRAMEF6Q5VXH4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRAMEF6Q5VXH4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms