Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms