Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms