Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms