Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HABP4Q5JVS0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms