Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHSL2Q5HYW2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHSL2Q5HYW2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHSL2Q5HYW2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NHSL2Q5HYW2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms