Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms