Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms