Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCGF3Q3KNV8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCGF3Q3KNV8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCGF3Q3KNV8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms