Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms