Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB5Q2M3G0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms