Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms