Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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