Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP6Q16828 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms