Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA2Q15822 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA2Q15822 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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