Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF4Q15306 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms