Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK3Q15120 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms