Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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