Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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