Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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