Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNB1Q14721 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms