Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBI3Q14213 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms