Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms