Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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