Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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SKP2Q13309 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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