Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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