Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STX4Q12846 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
STX4Q12846 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
STX4Q12846 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms