Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMAGPQ0VAQ4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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