Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms