Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms