Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBQ06643 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms