Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms