Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms