Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF85Q03923 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms