Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms