Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms