Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms