Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2BQ00403 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2BQ00403 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms