Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB2P80303 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms